Conformément à la législation fédérale en la matière, l’exécution de la lutte contre les épizooties incombe aux cantons. Pour ce faire, ils ont en principe le choix entre différentes stratégies :

• l’éradication des vecteurs (abattage et élimination des animaux malades),
• les vaccinations préventives,
• les contrôles épidémiologiques périodiques.

Chacune de ces mesures exige des responsables des ressources financières et humaines. Pour garantir ces tâches, le canton de Berne gère une Caisse des épizooties, alimentée par :

• les cotisations des détenteurs et détentrices d’animaux,
• les dépôts du canton en faveur de la lutte contre les zoonoses et des services sanitaires pour animaux.

La Caisse des épizooties prend en charge :

• les pertes d’animaux subies, ainsi que les frais occasionnés par la lutte, pour un grand nombre d’épizooties à déclaration obligatoire ;
• les frais liés à l'exercice de la police des épizooties ;
• les frais des vaccins, de la vaccination préventive, des médicaments, des analyses en laboratoire, du suivi des troupeaux par des vétérinaires officiels, de l'examen de l'environnement ;
• les frais des contrôles par sondage effectués en vue de l'admission des animaux indigènes sur le marché international ;
• certaines contributions aux •services sanitaires pour animaux.